部局横断型組織は、学部や研究科、研究所など縦割りの枠組み(部局)を、文字通り横断的につなぐ組織で、東大内のさまざまな部局の研究者が参画するのが特徴だ。社会的に求められる研究の推進や、研究者の連携に関して、縦割りの組織構造では柔軟な対応が難しかった。
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